女子高生・久遠空々梨（くどうくくり）は下校中、巨大隕石の落下に遭遇し、全人類は一瞬にして滅亡してしまう。――が、目を覚ますと、そこはなぜか衝突の３日前。混乱する空々梨に対し、従姉妹の非数値ヌル香（ひすうちぬるか）は衝撃の事実をつきつける――。普通の女子高生だった彼女が、実は星間諜報組織のエージェントだった！？